自清洗過濾器的清洗排污過程有時間、壓差、手動控制三種方式。

定時控制：用戶根據實際工況自行設置過濾時間和排污時間，自清洗過濾器將按照設定的過濾時間和排污時間循環工作。

手動控制：將選擇開關旋到手動位置時，減速機和排污閥得電，設備開始自動清洗濾芯和排污。手動控制狀態是檢查減速機和排污閥能否正常工作的手段，也是壓力控制狀態下不能正常工作的應急控制手段；如果設備在手動控制狀態下不能正常工作，則在壓力控制狀態下也不會正常工作。

壓差控制：將開關旋轉至壓差控制位置，在Y型過濾器進出水口的壓差值達到設定的壓差值時，將進行自動清洗排污，減速機轉動、排污閥打開排污。過濾器在設備內部清洗干凈后，自清洗過濾器進出水口的壓差值小于設定的壓差值時，過濾機的減速機停止轉動，排污閥則自動關閉。